MyMpn Project

DETAILED VIEW FOR MPNs011

Rna MPNs011

Stable ID	MPNs011
Description
Location	91205-92600 +
Sequence	TAAGAGATCCGCGTAACGGTTTTTAGCTTTATTCGCAATCAAAAACTGTCACTGCGTTATTCTCCACTTCTTTGTCATTT CACTTACACATTCATCACCGTTTTTAATTCAGGATGATGGGAGGTAAATAATGACCCAGTTAATAACTAGAAGGAGTGAT ACAAACAAGACAATAGCGGCAATGGCACCTGGCAGAATATTGGCACTTGTATTACCAGTAGCAATTCTTGGTGCATCTAA AAAGACAGACGTAATAATGTCAAAGATGCTGTAGAAGACGTAAGCAAAGCCTCACACATAACCAAAGATAATAGAAACTT CGTTGCGCTTGTATTCCTTGTACTCGTAAGGGAGAATCAAGATCGAGCTACCTAAACTTCAACCAAAACCACCAGCAATA AAGGTAAAGATACCCACAAACGTAAAGCCAACCACAGTATTTAAACCAAGCGTTGCAGCAAAGATTACTATTAACAACAC CAACACGGCGTTGGCCGTAAAGATAAAGTGGAGCCAACGCTTCTTGTCATAAATTGTTTTGTTAAACGGTGACAGTAAGA AGTAACCCAAGAGGTAACCCATTACCCAGAGAATTAATAAGATTGGACGGGCAGTTGGAATAATTGCTTTTTTAGCACCT GAAATAGCTAACAAGCTGTTAAACCAGGTTTGGGTTAACGGGTTAATTAAGAGAATTGTACCTACACCAGCTATTGCCAA CAGCTTCCAAGTTGTTTTGCGTTTCAAAATTGATAACGCACTTGGTCTCACACTCAAGCTTTGATTGGTTTTTGATTGCT TTTGGGGCAACATGTGATCGACCTTCTTTTCAAATCAAGCAAATACTAACAACATCGCAAACACCAATAAGATCATGAAC GTTACAACTCAAACCCAGTTAGCAGTCGCAAAGCGGCCAACACCTGGAATTAAGAAAGGTGCTGCCACAATTACAAGTCC TACGTTAAAACCTCAGAAGTTAGCATTCGATAAAATCGATTTCTTGCGGTTTGAAGAAAGGGAAGCAATAATTGGTTGCG CATAAGCAATTAAGGTCGTACCACCAATAGCAATCGTAGAACGGAAAATAATGAAAAACGCATAACCAGTCATTGACGCA CTGGTACCAATTTCGTTGCCGTTAATTCCTTTAATTAAGCTAACAGGAGTGCCGTCAGCCAACATAGTTTGACTACCCAC TTGAACAGGACCTAACAGTTGACCTTGTTGTAAACTGGAAGAAATTTTAGTAAGTTTACTTATTACTTCACTTGAAGCCG GTCGCAACAAGGTCAACTCGTTATGACCACCTAACGGACTACCGATAATTAAGAAAGGAAAACAAACACACATGAGTCCC ATCATGATCATCACTGCATGACGGTAACCAAACTTC
Operon	OP28
Operon location	91205 - 92600

ORFs (EMBOSS)

ORF description			Blast Hit (vs UniRef100)
Sequence	Location (nt)	Translation	QStart	QEnd	QSize	Target	TStart	TEnd	Evalue	Identity
TTAGCTTTATTCGCAATCAA AAACTGTCACTGCGTTATTC TCCACTTCTTTGTCATTTCA CTTACACATTCATCACCGTT TTTAATTCAGGATGATGGGA GG	91227-91328 +	MALFAIKNCHCVILHFFVIS LTHSSPFLIQDDGR	no hit
ATCCGCGTAACGGTTTTTAG CTTTATTCGCAATCAAAAAC TGTCACTGCGTTATTCTCCA CTTCTTTGTCATTTCACTTA CACATTCATCACCGTTTTTA ATTCAGGATGATGGGAGGTA AATAATGACCCAGTTAATAA C	91211-91351 +	MRVTVFSFIRNQKLSLRYSP LLCHFTYTFITVFNSGWWEV NNDPVNN	no hit
ATAATGACCCAGTTAATAAC TAGAAGGAGTGATACAAACA AGACAATAGCGGCAATGGCA CCTGGCAGAATATTGGCACT TGTATTACCAGTAGCAATTC TTGGTGCATCTAAAAAGACA GACGTAATAATGTCAAAGAT GCTG	91332-91475 +	MMTQLITRRSDTNKTIAAMA PGRILALVLPVAILGASKKT DVIMSKML	no hit
ATAACCAAAGATAATAGAAA CTTCGTTGCGCTTGTATTCC TTGTACTCGTAAGGGAGAAT CAAGATCGAGCTACC	91502-91576 +	MTKDNRNFVALVFLVLVREN QDRAT	no hit
ATTCCTTGTACTCGTAAGGG AGAATCAAGATCGAGCTACC TAAACTTCAACCAAAACCAC CAGCAA	91537-91602 +	MPCTRKGESRSSYLNFNQNH QQ	no hit
ATCAAGATCGAGCTACCTAA ACTTCAACCAAAACCACCAG CAATAAAGGTAAAGATACCC ACAAACGTAAAGCCAACCAC AGTATTTAAACCAAGCGTTG CAGCAAAGATTACTATTAAC AACACCAACACGGCGTTGGC CGTAAAGATAAAGTGGAGCC AACGCTTCTTGTCA	91560-91733 +	MKIELPKLQPKPPAIKVKIP TNVKPTTVFKPSVAAKITIN NTNTALAVKIKWSQRFLS	no hit
GTGACAGTAAGAAGTAACCC AAGAGGTAACCCATTACCCA GAGAATTAATAAGATTGGAC GGGCAGTTGGAA	91753-91824 +	MTVRSNPRGNPLPRELIRLD GQLE	no hit
TTGATTGGTTTTTGATTGCT TTTGGGGCAACATGTGATCG ACCTTCTTTTCAAATCAAGC AAATAC	91985-92050 +	MIGFWLLLGQHVIDLLFKSS KY	no hit
TTAAGAGAATTGTACCTACA CCAGCTATTGCCAACAGCTT CCAAGTTGTTTTGCGTTTCA AAATTGATAACGCACTTGGT CTCACACTCAAGCTTTGATT GGTTTTTGATTGCTTTTGGG GCAACATGTGATCGACCTTC TTTTCAAATCAAGCAAATAC TAACAACATCGCAAACACCA ATAAGATCATGAACGTTACA ACTCAAACCCAGT	91891-92103 +	MRELYLHQLLPTASKLFCVS KLITHLVSHSSFDWFLIAFG ATCDRPSFQIKQILTTSQTP IRSWTLQLKPS	no hit
ATTACCCAGAGAATTAATAA GATTGGACGGGCAGTTGGAA TAATTGCTTTTTTAGCACCT GAAATAGCTAACAAGCTGTT AAACCAGGTTTGGGTTAACG GGTTAATTAAGAGAATTGTA CCTACACCAGCTATTGCCAA CAGCTTCCAAGTTGTTTTGC GTTTCAAAATTGATAACGCA CTTGGTCTCACACTCAAGCT TTGATTGGTTTTTGATTGCT TTTGGGGCAACATGTGATCG ACCTTCTTTTCAAATCAAGC AAATACTAACAACATCGCAA ACACCAATAAGATCATGAAC GTTACAACTCAAACCCAGTT AGCAGTCGCAAAGCGGCCAA CACCTGGAATTAAGAAAGGT GCTGCCACAATTACAAGTCC TACGTTAAAACCTCAGAAGT TAGCATTCGATAAAATCGAT TTCTTGCGGTTTGAAGAAAG GGAAGCAATAATTGGTTGCG CA	91785-92246 +	MTQRINKIGRAVGIIAFLAP EIANKLLNQVWVNGLIKRIV PTPAIANSFQVVLRFKIDNA LGLTLKLWLVFDCFWGNMWS TFFSNQANTNNIANTNKIMN VTTQTQLAVAKRPTPGIKKG AATITSPTLKPQKLAFDKID FLRFEEREAIIGCA	no hit
TTATTACTTCACTTGAAGCC GGTCGCAACAAGGTCAACTC GTTATGACCACCTAACGGAC TACCGA	92464-92529 +	MLLHLKPVATRSTRYDHLTD YR	no hit
ATTGACGCACTGGTACCAAT TTCGTTGCCGTTAATTCCTT TAATTAAGCTAACAGGAGTG CCGTCAGCCAACATAGTTTG ACTACCCACTTGAACAGGAC CTAACAGTTGACCTTGTTGT AAACTGGAAGAAATTTTAGT AAGTTTACTTATTACTTCAC TTGAAGCCGGTCGCAACAAG GTCAACTCGTTATGACCACC TAACGGACTACCGATAATTA AGAAAGGAAAACAAACACAC ATGAGTCCCATCATGATCAT CACTGCATGACGG	92316-92588 +	MDALVPISLPLIPLIKLTGV PSANIVWLPTWTGPNSWPCC KLEEILVSLLITSLEAGRNK VNSLWPPNGLPIIKKGKQTH MSPIMIITAWR	no hit
TTAAGAAAGGAAAACAAACA CACATGAGTCCCATCATGAT CATCACTGCATGACGGTAAC CAAACT	92533-92598 +	MRKENKHTWVPSWSSLHDGN QT	no hit

IMAGE BROWSERS

OPERON OP28 (Genomic Overview)

Region:91205-92600

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